MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS8232 chromosome

Total Repeats: 6764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003485	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003485	T	6	6	15	20	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003485	T	6	6	22	27	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003485	A	6	6	40	45	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003485	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003485	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003485	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_003485	TC	3	6	1626	1631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_003485	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003485	TA	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003485	CTA	3	9	1666	1674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_003485	TTA	3	9	1676	1684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003485	TTA	2	6	1688	1693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003485	T	7	7	2871	2877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003485	TTA	2	6	2879	2884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003485	ATA	2	6	2897	2902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003485	TGAAA	2	10	2943	2952	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003485	A	6	6	2950	2955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003485	ATG	2	6	3064	3069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003485	A	7	7	3096	3102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003485	TAAA	2	8	3127	3134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003485	A	6	6	3169	3174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003485	AGA	2	6	3220	3225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003485	AAT	2	6	3298	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003485	TCT	2	6	3370	3375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_003485	TCT	2	6	3392	3397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_003485	T	6	6	3399	3404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003485	TAA	2	6	3409	3414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003485	TTGA	2	8	3417	3424	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003485	GAA	2	6	4590	4595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003485	AAC	2	6	8716	8721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_003485	GAAC	2	8	8751	8758	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_003485	TGC	2	6	8795	8800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_003485	A	6	6	8826	8831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003485	A	8	8	9516	9523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003485	A	6	6	9550	9555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003485	AGA	2	6	9591	9596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003485	A	7	7	9611	9617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003485	A	6	6	14755	14760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003485	T	6	6	14786	14791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003485	T	7	7	14866	14872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003485	TTA	2	6	14875	14880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003485	A	6	6	14936	14941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003485	AAT	2	6	14961	14966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003485	AGA	2	6	14967	14972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003485	AGA	2	6	14975	14980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003485	ACTA	2	8	15026	15033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_003485	TAG	2	6	15043	15048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003485	ATA	2	6	16476	16481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003485	ACATT	2	10	16489	16498	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_003485	AGT	2	6	16526	16531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003485	TACT	2	8	16544	16551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_003485	AT	3	6	16657	16662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003485	A	6	6	16676	16681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003485	A	8	8	16759	16766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003485	TAA	2	6	16799	16804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003485	AC	3	6	16827	16832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_003485	A	6	6	16839	16844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003485	AGT	2	6	16853	16858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003485	AAG	2	6	16888	16893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003485	AAAT	2	8	16988	16995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003485	AG	3	6	17039	17044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003485	GGC	2	6	17071	17076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_003485	ACCT	2	8	17162	17169	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_003485	AG	3	6	17214	17219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003485	CGA	2	6	17316	17321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_003485	GCA	2	6	17390	17395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_003485	CGC	2	6	17437	17442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_003485	GTGA	2	8	17443	17450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003485	TGT	2	6	17476	17481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003485	AGA	2	6	17485	17490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003485	ATG	2	6	17491	17496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003485	CCA	2	6	17512	17517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_003485	TAAC	2	8	17526	17533	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_003485	CAG	2	6	17559	17564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_003485	AGCG	2	8	17614	17621	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_003485	T	6	6	17629	17634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003485	AT	3	6	17743	17748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003485	GGA	2	6	17749	17754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003485	CT	3	6	17774	17779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_003485	GAA	2	6	18013	18018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003485	GGT	2	6	18087	18092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003485	GTC	2	6	18101	18106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_003485	TCGTG	2	10	18110	18119	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_003485	CAT	2	6	18169	18174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_003485	TAA	2	6	18204	18209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003485	GGA	2	6	18213	18218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003485	ATC	2	6	18237	18242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_003485	AC	3	6	18264	18269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_003485	TGGT	2	8	18279	18286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003485	CGC	2	6	18403	18408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_003485	AC	3	6	18433	18438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_003485	CAC	2	6	18448	18453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_003485	AGCC	2	8	18496	18503	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_003485	GAT	2	6	18519	18524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003485	CCT	2	6	18575	18580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_003485	AGG	2	6	18674	18679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003485	CTA	2	6	18720	18725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_003485	AACT	2	8	18754	18761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_003485	TG	3	6	18788	18793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003485	CA	3	6	18799	18804	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_003485	AGCG	2	8	18842	18849	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_003485	TA	3	6	18863	18868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003485	ATT	2	6	18962	18967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003485	TAA	2	6	18968	18973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003485	A	7	7	18986	18992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003485	TAA	2	6	18999	19004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003485	GTTAA	2	10	19006	19015	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003485	GAA	2	6	19052	19057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003485	ACG	2	6	19069	19074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_003485	GTAA	2	8	19092	19099	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003485	ACTA	2	8	19134	19141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_003485	GAAG	2	8	19174	19181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003485	TAG	2	6	19240	19245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003485	GCGA	2	8	19248	19255	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_003485	AGG	2	6	19262	19267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003485	AGA	2	6	19328	19333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003485	AG	3	6	19356	19361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003485	GGA	2	6	19444	19449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003485	CT	3	6	19470	19475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_003485	GGGAG	2	10	19525	19534	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003485	ACA	2	6	19562	19567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_003485	ATG	2	6	19629	19634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003485	TGT	2	6	19699	19704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003485	GGA	2	6	19762	19767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003485	TC	3	6	19848	19853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_003485	ATC	2	6	19969	19974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_003485	ACC	2	6	20027	20032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_003485	AGC	2	6	20107	20112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_003485	ATTC	2	8	20114	20121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_003485	TG	3	6	20238	20243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003485	AAG	2	6	20244	20249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003485	GAG	2	6	20259	20264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003485	GA	3	6	20389	20394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003485	TA	3	6	20443	20448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003485	CTAA	2	8	20470	20477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_003485	TAG	2	6	20572	20577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003485	GA	3	6	20685	20690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003485	CT	3	6	20800	20805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_003485	GAT	2	6	20818	20823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003485	AGG	2	6	20863	20868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003485	CGG	2	6	20909	20914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_003485	GA	3	6	21007	21012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003485	TAGG	2	8	21125	21132	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003485	GTT	2	6	21169	21174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003485	TAC	2	6	21179	21184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_003485	CCT	2	6	21267	21272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_003485	TTGG	2	8	21308	21315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_003485	AATC	2	8	21317	21324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_003485	GGT	2	6	21403	21408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003485	TCG	2	6	21518	21523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_003485	CGT	2	6	21598	21603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_003485	AGGGA	2	10	21736	21745	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
154	NC_003485	C	6	6	21774	21779	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
155	NC_003485	GA	3	6	21822	21827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_003485	AGTGTA	2	12	21849	21860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_003485	ACTAAT	2	12	21877	21888	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_003485	CAG	2	6	22039	22044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_003485	GCTTA	2	10	22102	22111	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_003485	AC	3	6	22115	22120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
161	NC_003485	AGT	2	6	22296	22301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_003485	T	6	6	22306	22311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_003485	CGT	2	6	22636	22641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_003485	GAG	2	6	22650	22655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_003485	T	6	6	22744	22749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_003485	CTC	2	6	22815	22820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_003485	AGA	2	6	22912	22917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_003485	AAAT	2	8	22989	22996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_003485	AG	3	6	23040	23045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
170	NC_003485	GGC	2	6	23072	23077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_003485	ACCT	2	8	23163	23170	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_003485	AG	3	6	23215	23220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_003485	CGA	2	6	23317	23322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_003485	GCA	2	6	23391	23396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_003485	CGC	2	6	23438	23443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
176	NC_003485	GTGA	2	8	23444	23451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
177	NC_003485	TGT	2	6	23477	23482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_003485	AGA	2	6	23486	23491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NC_003485	ATG	2	6	23492	23497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
180	NC_003485	CCA	2	6	23513	23518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_003485	TAAC	2	8	23527	23534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
182	NC_003485	CAG	2	6	23560	23565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_003485	AGCG	2	8	23615	23622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
184	NC_003485	T	6	6	23630	23635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_003485	AT	3	6	23744	23749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_003485	GGA	2	6	23750	23755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
187	NC_003485	CT	3	6	23775	23780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
188	NC_003485	GAA	2	6	24014	24019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
189	NC_003485	GGT	2	6	24088	24093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
190	NC_003485	GTC	2	6	24102	24107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
191	NC_003485	TCGTG	2	10	24111	24120	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
192	NC_003485	CAT	2	6	24170	24175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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195	NC_003485	ATC	2	6	24238	24243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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197	NC_003485	TGGT	2	8	24280	24287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
198	NC_003485	CGC	2	6	24404	24409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
199	NC_003485	AC	3	6	24434	24439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
200	NC_003485	CAC	2	6	24449	24454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
201	NC_003485	AGCC	2	8	24497	24504	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
202	NC_003485	GAT	2	6	24520	24525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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208	NC_003485	CA	3	6	24800	24805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
209	NC_003485	AGCG	2	8	24843	24850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
210	NC_003485	TA	3	6	24864	24869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
211	NC_003485	ATT	2	6	24963	24968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_003485	GA	3	6	27823	27828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_003485	GGT	2	6	29538	29543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
286	NC_003485	AT	4	8	29562	29569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_003485	TAAA	2	8	29716	29723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_003485	AGA	2	6	29730	29735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_003485	TCT	2	6	29745	29750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_003485	GTT	2	6	29873	29878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_003485	AGT	2	6	29902	29907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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